חיבור 'אלף בינה' טומן בחובו דרושים נפלאים על סדר כ"ב אותיות התורה. ובו נדרשים כל פסוקי מזמור קי"ט שבספר תהילים, מהם הוא מוציא מוסר השכל ולקחם של עניני המוסר. לאחריו הוא מבאר את המזמורים: כ"ה, ל"ד, קי"א וקי"ב.

סודות רבים מאורחות המוסר שמר רבינו לחיבור זה, ובו גילה הרבה מצפונות מחשבתו, על עבודת השי"ת, על מידותיו, ועל חובת האדם בעולמו. בו יאלף רבינו זי"ע את התלמידים 'בינה' לדעת מה יעשה וינצל מחטא ועוון.